日本通过明治维新快速跻身于强国之列，为什么明治维新在日本就能成功呢?其中倒幕战役成为了决定性因素。在德川幕府末期，日本经济比较发达的地区已经开始出现不同于封建经济的情况，导致幕府根基直接被动摇。加上大名、武士、商人和农民，他们对于改革有着迫切的希望，所以这些人组成了倒幕的坚实力量。黑船事件以后，倒幕运动彻底爆发，幕府再也没有能力维持现状了。
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在佩里的威胁下，日本不得不签订了《日米通商友好条约》，开放神奈川、兵库、新泻、大阪和长崎作为通商口岸，美国人拥有领事裁判权。
日本不但没有把佩里怒斥为侵略者
反而将其视为促进日本开国的功臣，树立雕像
同时，京都作为日本的神圣古都，其周边十里不允许被日本人视为天狗的美国人进入。然而，由于不得不允许和美国自由贸易，日本的生丝大量出口，导致京都的丝织品成本大幅上涨，京都商人大面积破产。随着物价高速飞涨，原本在京都不问政治两百多年的天皇和贵族们也不得不为将来担心了。
京都的朝廷虽然批准了条约，但孝明天皇却大为震怒，而签订这一条约的幕府更是被视为众矢之的，受到全日本的声讨，此前曾预言日本若不整备海防必沦为大清第二的先知者吉田松阴更是喊出了打倒幕府的口号。不过，聚集在孝明天皇身边的贵族和大名不想走的那么激进，他们首先想到的是利用德川幕府13代将军德川家定天生弱智、身体多病的弱点，尽快确立出身水户藩的一桥庆喜为将军继承人，与其他大名携手尊皇攘夷。
这个相对温和的办法因为保守力量在幕府内部占上风而早早夭折了。1858年，弱智将军德川家定突然暴病去世，由保守派大老井伊直弼拥立的14代将军、12岁的德川家茂继位。尽管井伊直弼对日本面临的内忧外患也有清醒认识，但他首先考虑的仍是重塑幕府权威。
1858年8月8日，孝明天皇向水户藩发出批评幕府，要求幕府改革的敕书。由于之前原计划以武力上京、威胁幕府进行改革的萨摩大名岛津齐彬意外去世，使这道著名的戊午诏书成为了一纸空炮。站稳脚跟的井伊直弼很快领导幕府开始反扑，指责该诏书是伪造，逮捕了水户藩的鹈饲吉左卫门、鹈饲幸吉，鹰司家的小林良典等人。京都的关白九条尚忠因此辞职。
不过幕府并没有就此罢手，而是掀起了更大规模的抓捕活动。京都所司代酒井忠义的家臣梅田云滨、水户藩主德川齐昭的心腹近藤茂左卫门、越前藩松平春岳的亲信桥本左内等100多人被抓捕处决。皇族青莲院宫尊融法亲王、德川齐昭和参与此事的多位大名则受到幕府处分，余生不再参加政治活动，史称“安政大狱”。血腥的镇压活动很快从京都蔓延到各地，不仅此前提倡打倒幕府的吉田松阴被处死，就连幕府内部主张宽大处理此事的川路圣谟和岩井忠濑也都被处分。一时间，京都上下人人自危，噤若寒蝉。
然而梦想着定于一尊的井伊直政没有想到的是，经过他的这一番操作，原本只是想推动幕府改良的各路诸侯现在迫于威胁不得不真的开始倒幕了。
从家康以来就喜欢利用忍者搞秘密政治的江户幕府很快收到报应，1860年3月3日，井伊直弼在江户城樱田门外的风雪中倒毙在水户脱藩浪人的长刀之下。之前被寄予厚望的幕政改良者松平庆永和一桥庆喜重新进入江户幕府的权力中心。然而，武装倒幕的车轮一旦转动，就再难停下。有一个人在这时悄悄登上了历史舞台，并决定性地改变了幕府占优的局势。
刺杀井伊直弼的樱田门外之变
这个人就是出生在德国北部小城威斯玛，却在1862年担任大英帝国驻日公使的萨道义。
英国和日本之间原本没有多少贸易额，英国议会对日本也漠不关心。但是，1857年，印度爆发了反英起义，同时，太平天国把与英国有着商业往来的长江流域扫荡一空。在和东方各民族打过交道以后，萨道义觉得，相比动不动把英国人投入黑牢的印度王公、言而无信的满清王爷、滥杀俘虏的李中堂，受过多年兰学熏陶和吉田松阴等人启蒙的日本人还是可以打交道的伙伴。正是由于萨道义的活动，日后英国支持明治维新和扶持日本在东方抵御沙俄的外交方针逐步确定下来。
从井伊直政之死中得到教训的幕府开始拉近与朝廷的关系，14代将军德川家茂与孝明天皇的妹妹和宫子内亲王结婚，摆出公武合体的姿态。然而，孝明天皇对幕府并不放心，在联姻确定后不久就接见了上京参觐的长州藩主毛利庆永，并赠诗给他“国势艰危风浪起，浮云蔽日昼犹昏，赖卿光辉照世间”。此后，萨摩的岛津久光也不甘落后上京觐见。
萨长的这种表现让幕府显得有些尴尬，1863年3月，德川家茂在5位大老簇拥下带3000人马上京，与天皇、将军后见德川庆喜一起参拜了京都的石清水八幡宫。而在这次上京途中，德川家茂受到的并未付诸实施的死亡威胁也让幕府有了整肃京都治安的想法。
从1862年起，京都的守备工作一直由会津藩主松平容保负责。理论上他应该提供1000名士兵负责京都的治安，但由于会津藩和幕末其他各藩一样遭遇了财政困难，所以实际上处于缺额状态。各藩的倒幕志士在幕府眼皮底下在京都大肆串联，联络公卿，让幕府非常头疼。为了解决这一问题，在出羽武士清河八郎倡导下，浪士组——后来的新选组就此诞生了。
1864年7月8日，新选组袭击了位于京都三条小桥附近的池田屋，杀死了20多名来自长州、土佐等地的倒幕人士，抓捕数十人。经此一战，新选组名声大噪，在幕府的支持下由成立时的几十人壮大到200多人，一时在京都横行无忌，又制造了多起暗杀事件。然而，有两个人侥幸躲过了这次袭击，一个叫桂小五郎(即木户孝允)，另一个叫坂本龙马。
制造池田屋骚动的新选组
从池田屋事变中死里逃生的木户孝允一回到长州，就开始鼓动藩里派兵上京，向天皇伸冤。1864年8月，长州藩2000多名士兵兵分三路，屯兵京都山崎、嵯峨和伏见，向朝廷献上进言书。
在御所内里总管德川庆喜的要求下，天皇下达了讨伐长州的命令。8月20日，长州军与守卫京都的幕府军发生激战。虽然原本驻防京都的会津军并不强，新选组纯属凑热闹，由于萨摩军加入幕府一方作战，使战斗形势变得对长州非常不利。尽管长州军一度打到离天皇近在咫尺的京都御所蛤御门，但在萨摩军的抵抗下，长州指挥官来岛右兵卫阵亡，400多人战死，不得不撤出战斗。撤退之际，气急败坏的长州士兵甚至炮击了天皇御所。经此一战，长州藩坐实了朝敌的罪名，在幕府组织的全国军队讨伐下，看来是毁灭在即了。
然而，出人意料的是，随后在坂本龙马的斡旋下，在这场禁门之变中打得你死我活的萨摩和长州，竟然联起手来对抗幕府。1866年3月7日，在京都萨摩藩邸，今天的京都同志社大学，萨长同盟正式成立，而在背后为萨长提供支持的，正是卖给他们军舰、火炮、步枪的大英帝国。
1867年10月12日，在第二次长州讨伐中一败涂地的末代将军德川庆喜，不得不在京都二条城接受了土佐藩主山内容堂的提议，实行大政奉还。然而，倒幕派并不满足于此。
10月14日，在德川庆喜的大政奉还请求书到达天皇手中同日，倒幕公卿岩仓具视就从年仅15岁的明治天皇手中拿到了讨伐幕府的密诏。另一方面，一旦幕府放弃权力，一些势力对此同样不满，又交杂着一些阴谋在内，11月15日，在京都伏见区的近江屋，大政奉还的主要建议者、一生多次大难不死的坂本龙马终于倒在刺客刀下，刺客是谁有多种说法，但笔者倾向是新选组。倒幕派与幕府之间的战争不可避免，京都将再一次、也是迄今最后一次变成战场。
1868年1月2日，德川庆喜在大阪会见各国公使，同时，3万幕府军向京都进发，在京都南部的鸟羽街道和伏见口与西乡隆盛指挥的5000讨幕联军发生激战。仅仅一天的时间，幕府军全面溃败。1月4日，惊慌失措的德川庆喜乘船逃离大阪。追击而来的长州军1月9日才接收大阪，曾经见证了丰臣家族灭亡的大阪城，如今也见证了德川幕府的日落夕阳。之后随着5月3日江户无血开城，倒幕战争正式宣告胜利。
倒幕的决定性战役——鸟羽伏见之战
在这场由低级武士掀起的历时十余载、波澜壮阔的维新运动中，京都始终是最重要的舞台。京都的许多町人、商人，也都出于对幕府的厌恶，自发地庇护维新人士，为其传递情报，像坂本龙马就曾藏身在河原町附近木材商的房屋中。
从河原町向北，是京都著名的维新之路，有多个江户时代参与倒幕的藩所旧址。这条路终点出町柳的常林寺，则是坂本龙马导师胜海舟被幕府免职后闲居的地方。在池田屋之变中血洒京都的多名长州人士，死后被供奉在京都东郊的护国神社，而他们导师吉田松阴所写的碑文，则永远刻印在了京都府立图书馆门前的石碑之上。
没落古都的特色复兴
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明治维新后，日本进行了大刀阔斧的改革，从此走上了经济发展的快车道。1868年人均收入只有大清一半的日本，到明治末期已经成为了追赶欧洲的发达国家。然而，与全日本的蓬勃向上相比，京都的发展速度却明显滞后了。
随着明治政府迁都东京，京都渐渐成了被遗忘的古都。虽然明治维新引进的许多新生事物——邮局、电车、电话、股份公司、银行等等也都在京都落地生根，1908年京都安装电话的已经达到了4000人之多，但京都的工商业并没有很大发展。在明治维新开始30多年后，京都的人口仅仅增长了3万人。在1898年成为京都首位民选市长的内贵甚三郎就职时提出的雄心勃勃的京都复兴计划——修建铁路、工厂和运河，因为资金问题到他卸任时仍然处于搁浅状态。
1904年，明治维新大英雄西乡隆盛的儿子——西乡菊次郎成为了京都第二任民选市长。尽管此时他的父亲已经去世多年，但凭借其在日本政界积累的丰富人脉，西乡菊次郎成功地获得了大藏省批准，为了京都市的公共设施建设发行地方债。
这在当时是一个相当大胆的做法，尤其是当时日本正处在日俄战争期间，从上到下都在勒紧裤腰带过日子。不过，依靠着京都市民对建设自己家乡的热情，西乡菊次郎的债券还是得到了认购。京都的各种公共工程和城市改造终于在他的任期内得以完成。京都也迎来了经济发展较快的时期，利用运河上水电站供应的电力，京都实现了全市电灯照明。到1912年西乡菊次郎卸任时，京都人口增长到50万人，虽然不及200万人的东京和130万人的大阪，仍然是日本第三大城市。
1912年日本还发生了一件大事，就是明治天皇的去世。日本进入了大正时代。在经济高速发展同时，日本的议会民主政治也不断进步，选举资格对财产的要求不断降低，到1925年实现了适龄男子普选。同时，在整个大正时代，日本的市民运动一直处于高涨状态。1915年要求政府取消营业税、纺织品消费税、通行税的市民运动中，京都是最活跃的城市之一。
大正天皇时代，昙花一现的“大正民主”
1927年，曾写下以京都为背景的小说《罗生门》的天才作家芥川龙之介自杀，预示了这个国家阴暗的未来。大正时代的民主光辉昙花一现，很快变成了昭和时代的全民狂热。曾经支配着世界秩序、用皇家海军为自由贸易保驾护航的大英帝国在一战后的衰落，和欧美各国纷纷在贸易上转向保守主义，让国内市场狭小的日本深受其害。京都的许多会社和银行也纷纷破产了。在贸易战中深受重创的日本最终走上了军国主义的扩张道路。
1937年侵华战争爆发后，日本开始全面转向战争体制，经济也开始转变为由政府主导的战争计划经济。京都的很多民营小企业被强制合并，转而生产战争所需的军需产品。京都市的地方自由选举被取消了，改成在政府指定的候选人中进行选举。
战前弥漫着自由主义和左翼思潮的大学更是成为重点整治对象，发表批评政府言论的大学教授被解聘，大中学生被要求参加军训，学校中成立报国会等右翼团体，对青年一代实行皇国至上思想洗脑。京都市区在战争中实行宵禁，严禁酒类买卖。太平洋战争爆发后，京都也像其他地方一样实行了食品配给制，粮食由政府调配。不过对京都市民来说不幸中的万幸是，这样的日子并不需要持续很久。
1941年4月，一个身材矮小、瘦削的中年人来到京都立命馆大学担任教授。之前一年，他的作品刚刚在立命馆出版社出版，但很快就成了禁书。他就是日本对外侵略的主要策划者，被称作战争大脑的石原莞尔。尽管此时日美战争还未爆发，石原却对日本的战争前途彻底失望。1938年他因为反对扩大侵华战争被下放到京都的舞鹤港担任要塞司令，现在又不得不退出服役。
早年丧失生育能力、同时是日莲宗虔诚信徒的石原声称自己在一次参拜日莲宗寺院时，面对西沉的夕阳领悟了最终战争的奥义。他声称，日本领导的东方文明和美国领导的西方文明必有一战，这场战争将会是人类的最终战争，飞机、潜艇、原子弹等先进武器将会被投入使用。但同时，他认为现在就与美国作战是不明智的，“为了石油去打仗是傻瓜行为”。日本一定会在这场战争中惨败，但由于苏联的存在，美国不会彻底消灭日本。日本未来的希望在于和中国组成东亚联盟，然后战胜美国主宰世界。
相比于这些天马行空的观念，石原在立命馆大学的课程更值得玩味。在两学期的战争史课程中，石原详细地讨论了1812年拿破仑征俄的失败和1795~1815英国对法国的海上封锁。前者不禁让人想起当时支配欧洲的希特勒发动的对苏联闪电战，后者则是美国对日本封锁的弱化版本。
就像石原预料的那样，军国主义者的洗脑终究敌不过美国人钢筋水泥的威力。战争很快烧到日本本土，京都也和其他城市一样遭到盟军轰炸。不过盟军出于对日本传统文化的尊重，更重要的是京都本身缺乏发达的工业设施，这些轰炸规模小得不值一提，仅仅在1945年京都东郊扔下了几枚炸弹，36人死亡。1945年8月，日本宣布投降，美国第六集团军作为胜利者接管了京都。
战后的日本陷入了深深的幻灭与恐慌之中，由于军事管制导致海外输入粮食和生产原料减少，物价在短短两年内上升了300倍。1950年，京都西北郊的金阁寺被本寺僧人烧毁，后来成了三岛由纪夫写作小说《金阁寺》的素材，也仿佛是这个动荡时代的寓言：
一个对佛教怀着深深理想主义出家的少年僧侣，在长期的苦修后终于对这座号称为了信仰而建造的寺院产生了深深的怀疑和自责，因为无法忍受金碧辉煌的寺院与外界苦难现实的强烈反差，最终将其付之一炬。战后的日本社会同样处在崩溃的边缘，不过幸运的是，他们遇到了麦克阿瑟。
金阁寺的焚毁也是战后日本病态心理的体现
被西方史学家看作20世纪最伟大军人的麦克阿瑟深谙马基雅维利的格言，即成功的改革往往保留了旧制度的外表。在不触动天皇制的前提下，他对日本社会进行了大刀阔斧的改造。彻底的普选实现了，选举权被扩大到妇女;恢复了大学自治和言论自由;地主的土地被分配给无地农民;庞大的家族财阀被拆解为数百个不相干的小公司;原本用于生产军火的工厂被改造成生产生活用品的企业;颁布了保护劳动者权益的法律，允许劳动者组织工会。
在经历了战后两年多的极度混乱后，日本经济走上了高速恢复发展的快车道。1951年，麦克阿瑟因韩战中的争议黯然离去，但日本经济却在3年后迎来了被称为“神武景气”的辉煌时期。1968年，日本超越西德成为世界第二经济大国。
麦克阿瑟帮日本人民清算军国主义
相比于其他城市的高速发展，缺乏良好自然禀赋的京都在经济上落了下来。好在从战后第一任民选市长神户正雄开始，京都就确立了建设文化都市的目标，并和西安、巴黎、基辅、波士顿、佛罗伦萨等城市结成了友谊城市。
今天的京都经济水平和人口数量都排在日本第7位，虽然仍远不及日本的一线城市，但其独有的历史底蕴和人文风情，幽雅静谧的生活环境，仍然吸引着世界各地的人们来这里旅行居住。千年的京都物语也是一部浓缩的日本史，正如京都市的市徽不死鸟一样，虽然迭遭苦难，但终将浴火重生。
最后，附送几个彩蛋。在大家喜欢的《名侦探柯南》中，虽然发生在京都的故事不多，但柯南剧场版中有3部是以京都为背景：2005年广受好评的《迷宫的十字路口》再现了源义经在京都出生成长所历经的地方;2012年《远海的侦探》发生在京都府下、石原莞尔最后任职的舞鹤港;2017年《唐红的恋歌》则以京都西郊风景幽雅的嵯峨野和渡月桥为背景。而养着一只灰貂做宠物的京都绫小路警部，他的姓氏自然是来源于京都的绫小路锦市场了。
如果各位读者对京都有兴趣，不妨循着柯南的足迹，在樱花飞舞的春天或红叶烂漫的秋季，来京都一探究竟吧!
