脐橙果树与其他柑橘相比，开花多、果实大，消耗的养分多，需肥量大。脐橙果树既需要氮、磷、钾、镁等大量元素，也需要硼、锌、铁、锰、铜、钼等微量元素。
1．施肥时期、肥料种类
无公害脐橙果树施肥时期的确定，应考虑各个物候期和各个生物学年龄时期的特点，根系对营养元素的需求规律以及与其他柑橘果树相比花量大、落花落果严重、单果大的特点。据日本报道，森田脐橙落花落果消耗的氮量占施肥量的33 9／5。
脐橙的幼树期、初结果期、成年(结果盛期)树期和衰老更新期的施肥时期、肥料种类也有不同。
(1)幼年树未结果的幼树施肥的目的在于促进枝梢生长，培养坚实的枝干和良好的骨架枝，迅速扩大树冠，为早结果、早丰产打下基础。所以脐橙幼树施肥以氮肥为主，其次是钾肥，磷肥再次。施肥的重点是攻(促发)春、夏、秋各次梢，使其抽生整齐，生长健壮。施肥次数因幼树根系弱，生长范围小，吸肥力弱，施肥宜少量多次，勤施薄(稀)施。一般在每次梢抽发前7～8天各施一次催梢肥，在顶芽自枯至新梢转绿时再施一次壮梢肥。通常11月加施一次基肥，1年施7～9次。北亚热带气温相对较低的脐橙产区，8月以后控制施用氮肥，以免抽生晚秋梢而受冻。除上述土壤施肥外，还可结合喷施农药进行根外追肥，肥料有氮、钾、磷和微量元素，生产上常用尿素、磷酸二氢钾等，1年可喷施3～4次，通常在各次梢新叶转绿前喷施。
(2)初结果树脐橙初结果树是指栽植后4～6年的树。此时树体进入结果，且由开始结果逐渐转向盛果期。施肥的目的是提高产量和继续扩大树冠、根系。施肥的重点是促发足够数量的结果母枝。由于脐橙初结果树主要的结果母枝是二次梢的春秋梢和一次梢的春梢、早秋梢，故施肥主要围绕促发春秋梢、春梢和早秋梢，重施春肥、秋肥和采后肥。为控制夏梢、晚秋梢，一般不施夏肥，以达壮梢、保叶保果和减少夏季落果。一般1年施4～5次肥。如地处中亚热带的四川西部脐橙产区，1年施催梢壮花肥、壮果促梢肥、营养积累肥和采后肥等4次。催梢壮花肥开春施入，促发春梢整齐健壮、花质好。以氮肥为主，配合磷钾肥。壮果促梢肥又称秋肥，即在早秋梢抽生期的7月中旬施用肥，以有机肥为主，配合施用速效肥。营养积累肥，在果实大量积累糖分，花芽分化开始贮备营养时的9月下旬至10月上旬施入，肥料用饼肥等有机肥，配合氮、磷、钾肥。采后肥即对一些结果过多，树势变弱的植株补施以氮为主的肥料，如人畜粪水肥。地处中亚热带的三峡库区的湖北秭归等脐橙产区则施催芽肥、壮果促梢肥和还阳肥等，即春施催芽肥，以速效氮、磷为主，在2月上旬芽前施下；壮果促梢肥为一年施肥的重要时期，7月中旬前后施下，氮、磷、钾肥料配合，施饼肥、复合肥或腐熟的人畜粪均可。还阳肥即采后肥，起恢复树势、促进花芽分化等作用，肥料以厩肥、饼肥、复合肥、人畜粪肥均可，最好提前施，在采果前施下。
(3)成年结果树成年结果树即盛果期树，其施肥一般根据抽梢、开花和结果等物候期确定。常施催梢肥、稳果肥、壮果肥和采果肥。催梢肥：在春梢发芽前10～15天施人，以速效性氮肥为主，以促春梢整齐、健壮生长，为翌年提供充实的结果母枝。稳果肥：由于脐橙抽发春梢、开花谢花和第一次生理落果等消耗养分多，如不加补充会加剧第二次生理落果，故在5月中、下旬施一次以速效氮肥为主、配合速效磷肥的稳果肥。壮果肥：目的是壮果，在稳果后秋梢抽生前施。肥料以复合肥(N：P20s：KzO在15。15：15或以上)或腐熟的饼肥、优质粪肥为主，磷钾肥配合。采果肥：在果实采收前后施入，以促树势恢复、花芽分化和增强树体越冬能力。肥料可用厩肥、堆肥等有机肥和复合肥。
(4)衰老更新树脐橙进入衰老更新期产量明显下降，树冠开始向心生长，树冠中、下部枝，内膛枝郁闭，枯枝增多；根系生长减弱，吸肥力减退，叶少花多，坐果率下降。对脐橙衰老更新树应地上部与地下部同时采取措施：地上部修剪，地下部适当断根施肥，使之更新复壮。施肥可结合2月中、下旬，7月上、中旬和9月上旬断根增施有机肥，促进根系生长，同时也可在脐橙萌芽、抽梢时施氮肥，促进春梢、夏梢、秋梢抽发整齐，使重剪后的植株迅速恢复树势。
