夏堇顶生或腋生，开放2-3朵花，三色堇青素主要为单一腋生。夏堇有紫绿色、桃红色、粉红、深蓝色、浅蓝色、深玫瑰色、蓝色、深桃红色和紫色，底部为白色；三色堇有紫色、白色、黄色三种颜色。夏堇叶为圆形，而三色堇叶相对锋利。
花形不同
夏堇通常顶生或腋生与茎，开有2~3朵，三色堇主要是单朵腋生。夏堇的花筒呈漏斗状，唇形花冠，花萼膨大，萼筒上有5条棱状翼。三色堇花萼五裂，但萼面比较平整颜色也更深一些。
总的来说，夏堇像是彩色的猪耳朵，三色堇更像是翩翩起舞的蝴蝶。
颜色不同
夏堇和三色堇的最大区别是颜色。夏堇的花色比较丰富，但就单朵花来说，三色堇的花朵的颜色更加色彩斑斓一些。
夏堇的花为紫红色、桃红色、粉红色、深蓝色、浅蓝色、深玫瑰红色、蓝紫色、深桃红色和紫色，但几乎每一朵花都是白色的，花瓣是其他颜色，喉部有一点黄色。三色堇不同，通常每朵花都有紫色、白色、黄色三色。上面花瓣通常是单一颜色，下部花瓣是三色花瓣，有彩色花瓣。
叶子不同
夏堇的叶子实际上与三色堇非常相似，对生的是椭圆形或卵圆形披针形，有锯齿状的边缘。但它们仍然可以看到细微的差别，例如三色堇的叶子更圆，而夏堇的叶子相对锋利。
其他差异
夏堇和三色堇的生长习性不一样。夏堇喜欢高温的环境不耐寒，而三色堇则刚好相反，较耐寒，喜凉爽。并且二者的花期也不一样，夏堇是在夏秋季节开放，而三色堇则是在冬季至春季开放的花，在这一点上，二者很好分辨，夏天和秋天开放的是夏堇，冬天和春天开的花就是三色堇。
