梵蒂冈机密档案室是由教皇建立，里面主要存放着历代教皇信件和一些机密文件，曾经记者、历史学家想要进入档案室都要经过批准。如今的机密档案室并没有那么机密，可以根据目录选择自己想看的文件，但是一般人还是不能进入。
一、梵蒂冈禁地
梵蒂冈机密档案室是和33号俱乐部、百慕大三角中的魔鬼三角洲一样并称为世界十大禁地之一，基本都是过去四个世纪的教皇们留下的私人信件和历史记录。此档案室由教皇保罗五世建立，他有一种清晰的历史感，认为教皇的信件和类似文件应该保存下来。但是，十七世纪意识形态控制得很严，普通民众不允许在私底下八卦国王或教皇的消息。因此，档案被锁了起来。
直到1881年，教皇利奥十三世才允许研究者查看部分机密档案室的内容。不过，查看文件不是那么简单的事，首先，记者、学生、业余历史学家，是不允许进入档案馆的。进入档案室，学者要进入圣安娜门，穿过瑞士卫兵，走过美景宫廷院，然后呈上证书，而且流程200年以来几乎都没有变过。
一旦某个相关机构，证明某人是个严格的学者，才能被获准进入其中，学者们会索取他们想参考的具体文件，每天仅允许索取三份文件。因此，比起浏览档案室的目录，他们必须从用意大利或拉丁文手写的目录中选择出具体文章。电脑是可以带进去的，但是不允许摄影，所以，学者们大部分时间都在阅览室里快速码字。
档案室有80公里长的书架，和追溯到八世纪的各类文件，仅可供参考的目录就有35000卷。在2012年，为了庆祝建馆400周年，100多份秘密文件被公之于众，这次展览被称作“神秘之光”，其中包括有关1633年对伽利略的审判的相关记录。
二、现代梵蒂冈机密档案室
梵蒂冈机密档案室除了名字很“机密”外别无其他机密可言，你可以阅览想看的文件，但不可以进入档案室。这里的文件是全部可以阅览的，但并没有被禁的科学理论和巨著的备份。你必须提交文件阅览的申请书，然后档案室就会将文档提供给你。
梵蒂冈档案馆的员工都是教授，这也是出于严肃的历史学术角度的需要。有人说，庇护十二世支持了希特勒，跟教会支持墨索里尼差不多的方式，或者更全面的支持。也有人说，教皇是与纳粹对着干的，他还帮助藏匿犹太人，以及其其他纳粹的侵略对象。
在这里面你唯一不可以一窥究竟的是75年内的文件，为了保护外交和政府信息。高度的机密性使得这些内容夺人眼球的同时，也使得它们被看管得很紧。事实上，梵蒂冈向外界想隐藏的并不是外星人，而是和墨索里尼串通一气的国家资助的恐怖主义有关，甚至很有可能还参与了希勒特的消灭犹太人计划。
梵蒂冈教廷雇佣着世界上最忠诚的教皇卫队——瑞士卫队，原教皇卫队，自改组为“瑞士卫队”以来，一直保持着100名队员的规模。手持古代长矛、腰间佩剑的他们表情严肃，纹丝不动，保卫着梵蒂冈的安全。卫队由100名瑞士籍罗马天主教信徒组成，作为保卫教会安全的他们，现已成为“梵蒂冈卫队”，“教皇卫队”的专属代词。
