农药残留标准包括农药残留限量标准（即最大残留限量）、农药残留检测方法标准等，与消费者直接关系最大的是食品或食用农产品中的农药残留限量标准。
我国与欧美、日本、澳大利亚等发达国家一样，采用国际上通用的风险评估技术和方法，以考虑最大可能的风险为原则，制定农药残留限量国家标准。具体方法和步骤如下：首先是根据农产品生产、加工、流通、消费、进出口各环节需要及农药使用实际情况，确定需要制定残留限量标准的农产品（或食品）和农药组合；
然后开展农药残留降解模拟动态试验、国民膳食结构调查和农药毒理学研究，分别获得农药在正常使用情况下残存于农产品（或食品）中的残留值（包括中间值、最大残留值等）、我国消费者膳食数据（不同地区、不同年龄、不同性别对每种食用农产品或食品的每天消费数量）和农药的毒性（包括每日允许摄入量、急性参考剂量等），并在此基础上开展农药残留膳食摄入风险评估，结果得到农药残留限量标准推荐值；最后经食品安全农药残留国家标准审评委员会审议通过后，由卫生部和农业部联合颁布实施。
需要特别指出的是，制定残留标准时，以最大可能的风险为基础，也就是执行最严格的安全要求；在此基础上，还要增加至少100倍的安全系数，举例来说，如果食品中某农药残留量为50mg/kg时，可能会出现安全风险，那么将标准定为0.5mg/kg。
