明崇俨死的很莫名其妙，历来被人们各种猜测，背后究竟有什么问题呢？
唐高宗仪凤四年，即公元679年夏，正谏大夫兼御医、皇家方术顾问明崇俨从皇宫出来，在随从的护卫下回了寓所。
黄昏时分，东都洛阳满城牡丹花香，令人沉醉。明崇俨独坐庭院，夕阳落于邙山，游人归自伊水。其时，月色满庭，江山清寂。庭院里夏花繁盛，映没石阶。院后即连邙山之野。花树丛中，明崇俨做了一个梦。他梦到一个雍容的女人长久地凝视着他。女人的面容如雾中花，她说：“君听我一曲。卜得上峡日，秋天风浪多。江陵一夜雨，肠断木兰歌。”
不知过去了多长时间，明崇俨睁开眼，回味着刚才的梦。这位被认为通灵的先生，也不知道这个梦意味着什么。正在这时，明崇俨在恍惚中感觉有些异样，似乎有个人从院墙上跳下。在他迟疑时，那人已上前，大喊了一声：“明崇俨先生！”
明崇俨一愣，下意识地应了一声：“我在这里。”
随后迎接他的是一把利剑。
明崇俨被刺后，唐高宗和武则天都很震惊，立即成立专案组调查此事。但大臣们希望刺杀案不了了之。因为，在他们的眼里明崇俨只不过是个江湖术士，死不足惜。关于明崇俨的死因，当时有如下几种传说：
一、为鬼神所杀。有大臣半开玩笑地说，明崇俨呀，不是说他精通异术，最善驱使鬼神为他办事吗？也许把鬼神逼急了，为鬼神所杀吧！
二、为流窜的强盗意外所杀。
三、被太子遣人所杀。
正史上记载的是第二种说法，当时流行的是第一种说法，但武则天坚信第三种说法。
当时，唐高宗已是暮年，武则天成为帝国的权力中心，常撇下皇帝丈夫，独自一人登上洛阳城楼接受群臣和百姓的朝贺。太子贤无法接受这样的事情一再发生下去，而武则天继续强化着自己不可冒犯的尊严，多次书面训诫这个不听话的儿子。
当时还有传言说：武则天曾多次秘密召见明崇俨，让他给自己的几个儿子看相。明崇俨很不客气地批评了太子贤，认为三子显或四子旦更有天子之姿。后来，消息传到了贤那里。此外，据说擅长巫术的明崇俨还总被武则天请去，秘密对贤进行诅咒。如今明崇俨被刺杀了，谁干的？
武则天说一定要查清此事，她希望从幕后挑出太子贤这根线。事与愿违，几个月下来并没有直接的证据证明贤被牵扯到案件中。武则天有些坐不住了，也许这时她还不知道狄仁杰、苏无名（唐朝另一位神探）有着过人的侦探才能，武则天与太子贤僵持了一年。直到转年，事情才发生变化：
在武则天的阴影中，郁郁寡欢的太子贤因亲近一个叫赵道生的近侍，而受到一名大臣的指责，认为这种同性恋行为有失太子风范。太子贤大发脾气，说我喜欢男人还是女人你们管得着吗？武则天认为管得着，她一直想办自己这个儿子。她派人秘密审讯赵道生，竟意外得知：
之前，他受太子委派，一手筹划了对明崇俨的刺杀行动。武则天随即派士兵闯入东宫，进行搜查，在马厩起获了上百副盔甲。没有兵器，只有盔甲，但这已是大事件了。武则天以刺杀大臣和私藏军械为罪名，将贤的太子位废了。此前她曾毒死过一个儿子：自己的长子弘，另一说：李弘死于肺结核病（古代称痨瘵），至于贤，后来被流放四川，最后被武则天逼迫自尽。武则天最喜欢的明崇俨死了，未来的女皇要她的儿子也必须死去。
准情人的死令未来的女皇伤感异常，而亲儿子的死又令她感到安慰：因为她借明崇俨一案，如愿地拔掉了通往女皇之路上非常重要的一棵荆棘。在贤活着的时候，曾写过一首著名的《黄台瓜辞》：“种瓜黄台下，瓜熟子离离。一摘使瓜好，再摘令瓜稀。三摘犹尚可，四摘抱蔓归。”在这首诗中，道出他对母亲的悲愤和期待。母亲啊，你确实是个旷古未有的女强人，但若把自己的儿子都杀了，你最后收获的只是空空的瓜蔓啊。他希望母亲绷紧的神经稍微放松一下，但问题是如果心慈手软了还是武则天吗？所以李贤的失望是必然的。
